Wagenaar was onder andere werkzaam in Rotterdam, als stafmedewerker bij de gemeente en later als gemeenteraadslid. Hij werkte ook bij het Ministerie van Justitie en als algemeen directeur van de Sociale Werkvoorziening Rotterdam.
In 1993 werd Wagenaar bestuurder bij het Zaans Medisch Centrum, waar hij werkte tot in 2005. Vanaf 2006 was hij werkzaam als interim-bestuurder bij verschillende ziekenhuizen. Naast zijn werk is hij actief geweest bij diverse organisaties, bijvoorbeeld als vice-voorzitter van het Centrum voor Dienstverlening in Rotterdam en in raden van toezicht van ggz-instellingen. (Zorgvisie – Mark van Dorresteijn)
Lees ook:
‘Psychiaters niet weg bij GGZ Delfland’
Onderzoek: geen fraude bij GGZ Delfland
Psychiaters GGZ Delfland beschuldigen raad van bestuur